《實驗室生物安全手冊》中明確說明：“生物安全柜可以有效減少由于氣溶膠暴露所造成的實驗室感染以及培養物交叉污染，生物安全柜同時也能保護工作環境"。生物安全柜(Biological safety cabinets，BSCs)是為操作原代培養物、菌毒株以及診斷性標本等具有感染性的實驗材料時，用來保護工作人員、實驗室環境以及實驗品，使其避免暴露于上述操作過程中可能產生的感染性氣溶膠和濺出物而設計的。
通風柜是為在化學實驗過程中清除腐蝕性化學氣體和有毒煙霧而設計的。分為外接管道通風柜和凈氣型通風柜。凈氣型通風柜主要用于保護實驗室人員免受有毒化學氣體和煙霧吸入危害，也可用于防止粉末吸入危害。
超凈工作臺是為了保護試驗品或產品而設計的，通過吹過工作區域的垂直或水平層流空氣防止試驗品或產品受到工作區域外粉塵或細菌的污染。一旦微生物樣品放置于工作區域，層流空氣將把帶有微生物介質的空氣吹向前臺工作人員而產生危險。
通風柜和超凈工作臺不屬于生物安全柜，不可使用在涉及微生物材料的實驗或生產過程中。
通風櫥 | 超凈工作臺 | 生物安全柜 | |
功能區別 | 保護人，不保護樣品 | 保護樣品，不保護人 | 保護人和樣品 |
工作原理區別 | 負壓形式，風是從下往上抽
| 正壓形式，風是從上往下吹（也有水平流） | 正壓和負壓兩種結合 |
生物安全柜的選擇基本取決于生物試驗中所使用的試驗品類型：
1.如果生物試驗中涉及了微生物樣品和微量化學試劑(非腐蝕性)，使用裝備外排管道的安全柜是必要的。因為HEPA過濾器并不能有效過濾清除化學氣體，如果不能外排，將對實驗室內工作人員和環境造成威脅;
2.生物試驗中只涉及微生物樣品，可以使用基本類型的生物安全柜;
3.如果生物試驗中涉及了細胞毒素類藥物，例如各類癌癥治療藥物，必須使用的細胞毒素安全柜。
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